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一是馆藏中药标本量居全国第一。该博物馆位于全国最早专门从事中药研究的重庆市中药研究院内，为目前我市唯一的国有中医药博物馆。馆藏各类中药标本超38万份、模式标本180余份，涉及物种6500余个，不少种类为国内乃至世界的珍稀物种。
二是展示中西部中医药史。馆藏中药标本采集时间跨度长达70余年，主要采集于我国中药资源最为丰富、生物多样性及物种最具特色的西南地区、青藏高原及西北地区，记录了我国西南和西部珍贵中药资料，以及国内乃至世界的珍稀物种。
三是晋升中医药科普教育基地。先后加入国家标本资源共享平台和中国数字植物标本馆，实现网络资源共享。因该馆其馆藏量多、物种丰富、时间跨度大成为重庆、西南乃至全国中医药科普教育重要基地，为弘扬中医药传统文化，促进中医药合作与交流发挥积极作用。
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